L’information médicale sur Internet

L’information médicale sur Internet

[email protected] à jour 2007

Accès à Internet

Depuis un lieu privé La connexion

• Bas débit : Ligne téléphonique et modem RTC• Haut débit

• ADSL / NUMERIS• câble• Réseau hertzien• WIMAX• GPRS, EDGE, 3G, 3G+

• Satellite Depuis l’hôpital ou la clinique

Réseau « privé » Intranet et Internet

Connexion ADSL

Modem Filtre ADSL

Prise téléphone

StandardTéléphoniqueDégroupage

Connexion depuis un réseau local

Réseau localIntranet

Privé

Réseau « tiers »RENATER

RSS

Internet

Routeur etFirewall

Routeur etFirewall

Accès à Internet

Les fournisseurs de service• RENATER

• Réseau Santé Social

• Les fournisseurs généraux• Orange• Télé2• Free• ….

Accès à Internet

Les débits Nécessaires dépendent des utilisations

• Texte : faible• Téléchargement : rapide• Multimédia (images, vidéo…) : très rapide

Variables selon :• Le matériel utilisé• Le type de connexion• Le type de contrat

Accès à Internet

L’adresse IP Permet d’identifier de manière unique une

« ressource » (ordinateur, imprimante…) sur le réseau

Structure :• xxxx.xxxx.xxxx.xxxx • Exemple 193.54.11.18

Adresse fixe / Adresse variable (DHCP) Adresse privée / Adresse publique (NAT)

Accès à Internet

L’URL : Uniform Ressource Locator Mémoriser une adresse IP n’est pas facile…

L’adresse IP peut ne pas être fixe…

A chaque ressource un nom

• www.ciril.fr

Suffixegov : governementgouv : gouvernementcom : commercialfr : france

Organismeciril : centre lorrain d’info.

Accès à Internet

Localisation physique de la ressource Importante pour une imprimante…. Sans importance pour un accès à une

information mais :• Il faut pouvoir y accéder

• Il faut pouvoir y attribuer un certain crédit

Connexion depuis un réseau local

Routeur etFirewall

Réseau localIntranet

Privé

Internet

Routeur etFirewall

Réseau « tiers »RENATER

192.168.0.2

192.168.0.3

192.168.0.37

192.168.0.36

192.168.0.35

192.168.0.34

192.168.0.33

192.168.0.32

192.168.0.200www.intanet.chu-nancy.fr

193.54.11.205

193.154.11.200www.renater.fr

Syndication : RSS/Podscast

Trois notions : Serveur HTML classique

• Page statique Web 2 : Page dynamique

• Base de données Fil RSS

• Description des métadonnées en XML

• Postionnement des fichiers à télécharger

L’information est-elle de qualité ?

Auteur ? Date ? Organisme ? …. => Netscoring => HUN

Les documents et leur indexation

Principes généraux

L’indexation du document et de la requête est : Automatique : full text (moteur web) Manuel : par un expert utilisant un langage contrôlé : MESH

(synonymes, lien entre les concepts…) La sélection est automatique

Implicite (moteur web) Explicite (équation de recherche)

Document original Question

LANGAGEIndexation Requête

Sélection

Requête indexéeDocument indexé

Qualité d’un système

Complétude : Description complète du domaine médical

Non ambiguïté : Les termes ne doivent faire référence qu'à un seul concept.

Non redondance : Chaque concept ne doit pouvoir être exprimé que d'une

seule façon. Existence de synonymes :

Ce sont des termes intermédiaires qui font référence à un terme unique

Existence de relation explicites : "est-un", "est cause de ", "associé à", "équivalent à", "est

dans", "est avant"...

Critères de pertinence

Taux de rappel : Documents pertinents retrouvés /

Documents existants Silence :

100 - Tx de rappel Précision (relevance) :

Documents pertinents retrouvés / Documents retrouvés /

Bruit : 100 – Précision

L’indexation manuelle des ressources médicales

Description des ressources dans un format standardisé : SCORM, dublin core LOM

Pré-indexation automatique : Utilisation des champs structurés de SCORM Full text

Travail humain de bulletinage et référencement de la ressource

CISMeF : CHU de Rouen

MeSH

Le MeSH (Medical Subject Headings) est le thesaurus de la base Medline, thésaurus de référence dans le domaine biomédical.

Outil d'indexation, de recherche et de classement, il est produit par la NLM (National Library of Medicine, U.S.A.) avec la participation de l'Inserm pour la version française.

MeSH

L’indexation s’applique au contenu du document Langage

Normalisé

• Un concept = un terme ou ensemble de synonymes

• Un descripteur = concept « préféré » parmi ensemble de concepts

Structuré

• Descripteurs MeSh organisés hiérarchiquement (11 niveaux max)

Evolutif :

• Mise à jour annuelle

Exemple

MeSH

15 domaines principaux

MeSH

Pour traduire un concept il faut utiliser le descripteur le plus

spécifique

S’il n’existe pas de descripteur spécifique, utiliser des

combinaisons de Descripteur/Qualificatif

Il existe 83 qualificatifs

Maladie/Etiologie

Maladie/Complication

Maladie/Thérapeutique

• Le qualificatif thérapeutique inclut Détothérapie, traitement médicamenteux, soins infirmiers,

prévention et contrôle, radiothérapie, rééducation et réadaptation, chirurgie, transplantation

MeSH

MeSH Browser de la NLM CISMeF

SCORM

SCORM (Sharable Content Object Reference Model) est une spécification permettant de créer des objets pédagogiques structurés

SCORM

SCORM peut être découpé en plusieurs parties distinctes : le « modèle d'agrégation du contenu » : stockage,

d'identification, de conditionnement d'échange et de

repérage du contenu ;

l' « environnement d'exécution »

le « modèle de séquencement et de navigation » Il

décrit comment le système interprète les règles de

séquencement.

Agrégation de contenu

« Learning Object Metadata » (LOM). Ces méta-

données, utilisées dans les standards d'IEEE,

d'Ariadne et IMS, permettent la définition d'un

dictionnaire de termes décrivant le contenu

les métadonnées et le(s) fichier(s) XML, réutilisé de

IMS. Cela définit comment coder les fichiers XML

L'empaquetage : il s'agit de créer une archive zip

contenant tous les fichiers appropriés, ainsi qu'un

fichier manifest.XML

LOM et LOM-Fr

Moteurs et métamoteurs

Moteurs d’indexation (GOOGLE, YAHOO, LYCOS….) Automates qui explorent les pages web

accessibles et les analysent automatiquement Indexation full text Ne voient pas

• les serveurs « cachés », • les pages dynamiques issues de « bases de

données propriétaires » • exemple : PUBMED.

• On doit alors se connecter sur l’URL de l’administrateur de la base de données www.nlm.nih.gov.

Métamoteurs

Permettent la saisie de la requête Transmettent la requête à un

ensemble de moteurs Récupèrent les résultats issus de

chaque moteur et les présentent à l’utilisateur

COPERNIC, METACROWLER….

Accès gratuit/payant De très nombreuses bases de données de

références bibliographiques intéressent la médecine : Medline et son moteur d’interrogation gratuit

pubmed Pascal : payant ADM (Rennes) : gratuit Revues en ligne : payant

• Abonnements groupés (SDC de la faculté…) Et les autres BIOSIS, CHEMABS, EDFdoc….

Quand le service est payant, il nécessite le plus souvent la signature d’un contrat qui définit les modalités d’accès (login pwd) et de facturation.

De la référence au document

La recherche peut soit : Donner accès à la ressource dans son

intégralité : revue en ligne, texte complet d’un article, thèse, polycopié, images, cours….

Donner accès à la référence de la ressource. Par l’intermédiaire de pubmed, on a la référence des articles mais pas l’article. Celui-ci doit être « commandé » en ligne ou de manière traditionnelle.

L’UMVF

Université médicale virtuelle francophone.

GIP : 19 universités adhérentes + 2 en cours d’adhésion

Mettre à disposition des ressources pédagogiques des différents campus médicaux existant et à venir.

www.umvf.org

Quelques liens Sites

www.nlm.nih.gov www.chu-rouen.fr www.umvf.org

Moteurs www.google.fr www.yahoo.fr www.lycos.fr

Métamoteurs www.copernic.com www.altavista.com www.metacrawler.com