BIOMOLECULES & METABOLISMES (2015-2016)

Test d’auto-évaluation.

Durée 1h

Question-1 (4 points). Soit le schéma ci-dessous:

1- Décrire les étapes A, B et C (2 lignes maximum par étape) et les phases 1 et 2 (1 ligne maximum) 2- Donner un titre à ce schéma

Question-2 (6 points). Le signal mannose-6-phosphate. A quelle étape de la N-glycosylation correspond-il? Quelle(s) protéine(s) concerne-t-il? Détailler par un schéma les réactions nécessaires à sa mise en place.

Question-3 (4 points). A l’aide d’un tableau, décrire les différences entre la N- et la O-glycosylation

Question-4 (6 points). Le glycosyl-phosphatidyl-inositol. Sa structure, le mécanisme de son transfert aux protéines et quelques fonctions biologiques

1- (1,5 points) A: Basculement de l’oligosaccharide ppGlcNAc2Man5 de la face cytosolique à la lumière du réticulum endoplasmique (RE). B: Ajout de 4 résidus de mannose et 3 résidus de glucose, sous forme Dol-pp-Man et Dol-pp-Glc pour atteindre la structure ppGlcNAc2Man9Glc3. C: Transfert en bloc de l’oligosaccharide GlcNAc2Man9Glc3 sur la protéine naissante. Cette réaction est catalysée par le complexe enzymatique Oligosaccharidyl-transférase (OST).

Phase-1: Synthèse du dolichol-oligosaccharide Dol-ppGlcNAc2Man9Glc3 (1 point)

Phase-2: Transfert de l’oligosaccharide sur une protéine naissante [sur le sequon Asn-X-Ser(thr)] (1 point)

2- Titre (1 point) : Processus de la N-glycosylation des protéines.

Question-1 (4,5 points). Soit le schéma ci-dessous:

1- Décrire les étapes A, B et C (2 lignes maximum par étape) et les phases 1 et 2 (1 ligne maximum) 2- Donner un titre à ce schéma

Question-2 (6 points). Le signal mannose-6-phosphate. A quelle étape de la N-glycosylation correspond-il? Quelle(s) protéine(s) concerne-t-il? Détailler par un schéma les réactions nécessaires à sa mise en place.

- A quelle étape de la N-glycosylation correspond-il? Il correspond à l’étape de la diversification de la N-glycosylation, suite à l’élagage («trimming») d’un premier résidu de mannose (facultatif: passage de Asn-GlcNAC2-Man9 à Asn-GlcNAC2-Man8)

- Quelle(s) protéine(s) concerne-t-il? Signal d’adressage des enzymes lysozomiales

- Détailler par un schéma les réactions nécessaires à sa mise en place. Voir ci-dessous

Question-3 (4 points). Il existe au moins 5 différences majeures entre la N- et la O-glycosylation. Quelles sont elles? Utiliser un tableau.

N-glycoprotéines O-glycoprotéines

•  Acide aminé concerné Asn Ser/Thr •  Séquence concensus de glycosylation: Oui Non •  Assemblage des sucres avant transfert Oui Transfert un par un •  Enzyme de transfert 1 seule (OST) Au moins 11 enzymes •  Modification co-traductionnelle Oui (RE) Post-traductionnelles

Question-4 (6 points). Le glycosyl-phosphatidyl-inositol. Sa structure, le mécanisme de son transfert aux protéines et quelques fonctions biologiques

Quelques fonctions de la glypiation:

- Suppression des gènes -> léthale. Donc vitale pour la cellule - Acroissement de la mobilité membranaire de la protéine glypiée - Facilité de clivage ( lipolytique -> compatibilité membranaire) -  Facilité d’endocytose/recyclage -  …