Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie ?· Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie Métabolique…

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    11-Sep-2018

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Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie Mtabolique 1. Rappel en Bionergtique Thermodynamique Aspect Enzymatique Oxydorduction 2. La chane respiratoire mithocondriale (CRM) Les diffrents complexes Thorie chimio-osmotique Bilans nergtiques 3. Le mtabolisme 3.1. Le mtabolisme des glucides Voie dEmbden-Meyerhof : la glycolyse Ractions Bilan nergtique Les sources de glucose Rgulation Devenir du pyruvate La glycognognse La noglucognognse 3.2. Le cycle de Krebs Les ractions Le bilan nergtique 3.3. Le mtabolisme des lipides La -oxydation des acides gras Activation Transport Etapes de la dgradation Bilans energtiques Cas particuliers La voie de Wakil Formation du palmitate Dsaturations Formation des Triglycrides 3.4. Le mtabolisme des protines Dgradation des acides amins Dsamination oxydative Transamination Cycle de lure Dgradation du squelette carbon Synthses de certains acides amins Quelques sites : http://ww.snv.jussieu.fr/bmedia/ http://www.gwu.edu/~mpb/index.html http://fr.wikibooks.org/wiki/Les_principales_voies_du_m%C3%A9tabolisme#La_cha.C3.AEne_respiratoire BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 3 / 16 NNNNNH2OOHOHCH2OPOPOOHO OHOCH2CHOHCHOHCHOHCH2NNNNHOOH3CH3CFAD CH2HNNHNNHOOH3CH3CFADH2 NN NNNH2OOHOHCH2OPOOHOPOHO OOOHOHCH2 NCONH2+NAD+ NCONH2NADH + H+ OOOHCH2NADP+ - NADPH + H+P OHOOH BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 4 / 16 NN NNNH2OOHOCH2OPOOHOPOHO O CH2Co-enzyme AP OHOOHC CHOHCH3CH3CO NH CH2 CH2 CO NH CH2 CH2 SHacide panthothnique-mercaptothylamineNN NNNH2OOHOHCH2OPOPOPHOOOHOOOH OHAMPADPATP BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 5 / 16 Les complexes de la chane respiratoire mitochondriale Composition des complexes de la chane de transport dlectrons Complexe protomres masse molaire(kDa) Composants complexe I : NADH-coenzyme Q oxydorductase 25 800 1 FMN22 24 atomes Fe - S dans 5 8 centres complexe II : succinate-coenzyme Q oxydorductase 4 125 1 FAD7 8 atomes Fe - S dans 3 centrescytochrome b complexe III : coenzyme Q-cytochrome c oxydorductase 8 2 centres Fe - Scytochrome b560cytochrome b566cytochrome c1 complexe IV : cytochrome c oxydase 12 220 cytochrome acytochrome a32 ions cuivre Complex I NADH + H+ FMN Fe2+S CoQ NAD+ FMNH2 Fe3+S CoQH2 Complex II Succinate FAD Fe2+S CoQ Fumarate FADH2 Fe3+S CoQH2 Complex III CoQH2 cyt b ox Fe2+S cyt c1 ox cyt c redCoQ cyt b red Fe3+S cyt c1 red cyt c ox Complex IV cyt c red cyt a ox cyt a3 red O2 cyt c ox cyt a red cyt a3 ox 2 H2O ATPase (complexe V) BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 6 / 16 La CRM : les complexes et les lments mobiles Le gradient de protons Les bilans nergtiques de la CRM BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 7 / 16 Les ractions de la Glycolyse Bilans nergtiques de la glycolyse Valeurs des enthalpies libres standards et physiologiques des ractions de la glycolyse G0 G Raction kJ.mol-1 1 -16,7 -33,5 2 +1,7 -2,5 3 -14,2 -22,2 4 +23,9 -1,3 5 +7,6 +2,5 6 +12,6 -3,4 7 -37,6 +2,6 8 +8,8 +1,6 9 +3,4 -6,6 10 -62,8 -33,4 BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 8 / 16 Fructose et Galactose : autres sources de glucose pour la glycolyse La glycognolyse Rgulation, de la phosphorylase Bilan de la glycognolyse BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 9 / 16 Rgulation de la glycolyse Fermentation lactique et son bilan nergtique Fermentation alcoolique BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 10 / 16 Dcarboxylation oxydative du pyruvate Rgulation de la PDH Les navettes BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 11 / 16 Rgulation de la glucognognse Glucognognse Noglucognognse BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 12 / 16 Les ractions du cycle de Krebs Valeurs des enthalpies libres standards des ractions du cycle de Krebs Raction G0 kJ.mol-1 1 -32,2 2 +6,3 3 -20,9 4 -33,5 5 -2,9 6 0,0 7 -3,8 8 +29,7 Description de la raction 4 du cycle de Krebs BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 13 / 16 Bilan nergtique du cycle de Krebs Bilan nergtique de la Glycolyse et du Cycle de Krebs Rgulation du cycle de Krebs BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 14 / 16 Activation des acides gras Transport Carnitine Hlice de Lynen Bilan nergtique de la -oxydation des acides gras BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 15 / 16 Navette citrate Etapes de la synthse des acides gras Bilan de la synthse du palmitate BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU 16 / 16 Dgradation du groupement amine des acides amins Cycle de lUre Elimination de lure Dgradation du squelette carbon Schma des voies de synthse des acides amins

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