Curriculum Vitae Marina Takane Rue des Evaux 5 1213 Onex, Suisse +41.22.793.4904 marina.takane@mail.mcgill.ca Date de naissance: 3 août, 1979 Langues: anglais, japonais, français Éducation: - Master en Statistique à l’Université de Genève – graduation en hiver 2007. Moyenne arithmétique: 5.5/6.0 - Master en informatique à McGill University – graduation en février 2004. Note cumulative : 4.0 / 4.0 - Bachelor en “Joint Honours Mathematics & Computer Science” à McGill

University – graduation en juin 2001 avec distinction “First-Class Honours”. Note cumulative : 3.74 / 4.0 - Diplôme d’études collegiales en Sciences Pures et Appliquées à Marianopolis

College – graduation en juin 1998 avec distinction “Dean’s Honour List”. Note cumulative : A (90% - 95%) - Diplôme d’études secondaires à St. Georges High School – graduation en juin 1996. Note cumulative : A (85% - 95%) Bourses et prix: - NSERC PGSB – CAN$21,000 x 2 ans (décerné le 03/2004, décliné) - FQRNT B2 – CAN$20,000 x 3 ans (décerné le 10/2003, décliné) - NSERC PGSB – CAN$21,000 x 2 ans (décerné 03/2003, décliné) - McGill Top-Up – CAN$5,000 (décerné le 04/2003, décliné) - FCAR Bourse de maîtrise en recherche (B1) – CAN$15,000 x 2 ans (09/2001 –

08/2003) - McGill IT Fellowship – CAN$17,500 (décerné 04/2001, décliné) - NSERC USRA – CAN$4,500 (été 2001) - McGill Entrance Scholarship – CAN$2,000 (1998) Publications: - Takane, M. Inference of Gene Regulatory Networks from Large Scale Expression

Data. Master's thesis, McGill University, Montr���, Qu����, August 2003. J’ai appliqué des réseaux neuronaux en temps continu à des données d’expression génétique pour inférer le réseau régulateur génétique.

- Lee, P., Takane, M., Sladek, R., Hudson, T., Hallett, M. Decision Tree Inference of Gene Expression Profiles of Recombinant Congenic Strains. Joint CSHL/Wellcome Trust Conference Genome Informatics. September 4-8. Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, United Kingdom, 2002. (Poster)

Étant donné les données de génotype et de phénotype pour des souris RCS, ainsi que les niveaux de mRNA pour un sous-ensemble de gènes, nous avons utilisé des arbres de décision binaire pour inférer les associations entre les

gènes et les phénotypes. - Oshima-Takane, Y., Takane, M., Takane, Y. Learning of first, second, and third

person pronouns. Proceedings of the 20th annual conference of the Cognitive Science Society. pp. 800--805, 1998.

Expériences de travail: - 08/2001 – aujourd’hui - révision d’articles de recherche, incluant :

Lo, S. Thèse de doctorat, Université de Genève, 2006. Oshima-Takane, Y., Ariyama, J., Katerelos, M., Poulin-Dubois, D. Word-Action Mapping in Japanese Children: Role of Morphosyntactic Cues, 2005. Oshima-Takane, Y. Acquisition of nouns and verbs in Japanese, 2004.

(et des dizaines d’autres.) - 01/2004 – aujourd’hui - cours privés d’anglais. - 12/2004 – 09/2005 - informatique et traduction pour Tressonne LLC

Développement web, administration de système Windows, traduction anglais-français-japonais de dépliants et sites web.

- 09/2002 – 12/2002 - assistant pour Computational Biology Methods (308-562) avec Dr. Mike Hallett (correction de devoirs, heures de bureau)

Alignement de séquences, modèles d’évolution, matrices PAM, alignement de multiples séquences, arbres à suffixe, phylogénétique, recherche de gènes, microarrays, agglomérations (“clustering”), réseaux régulateurs, prédiction de structure de protéine, réseaux Bayesiens.

- 01/2002 – 04/2002 - assistant pour Algorithm Design Techniques (308-360) avec Dr. David Avis (correction de devoirs et d’examens, exercices hebdomadaires)

- 09/2001 – 12/2001 - assistant pour Algorithm Design Techniques (308-360) avec Dr. David Bryant (correction de devoirs et d’examens, exercices hebdomadaires)

- 05/2001 – 08/2001 – assistant de recherche avec Mike Hallett au McGill Centre for Bioinformatics

- 1996 – 2000 (étés) - assistant de recherche pour Dr. Oshima-Takane au Laboratory for Natural and Simulated Cognition, Département de Psychologie, McGill.

Compétences: - Statistique: régression linéaires, tests d’hypothèses, maximum de vraisemblance,

modèles linéaires et additifs généralisés, analyse descriptive multivariée, analyse des composantes principales, MDS, modèles ARMA, statistiques robustes.

- Langages de programmation: Matlab, SPlus, R, Python, Lisp. - Biologie computationelle: prédiction de réseaux régulateurs génétiques,

transcription factors, arbres phylogénétiques, prédiction de structure secondaire de protéine.

- Apprentissage machine (“machine learning”): réseaux neuronaux, arbres de décision, classificateurs Bayesiens naïfs, réseaux Bayesians.

Réferences: Mike Hallett Elvezio Ronchetti McGill Centre for Bioinformatics Département d’économétrie Tél: 1-514-398-5928 Université de Genève hallett@mcb.mcgill.ca Tel : +41.22.379.8131 Elvezio.Ronchetti@metri.unige.ch