Faculté de médecine Paris 5

Cours de biochimie et de

Biologie Moléculaire

PCEM 1

2006-2007

Cours de Biochimie et de Biologie Moléculaire Faculté de Médecine Paris5

2006-2007

* Biologie moléculaire et Biochimie des Acides nucléiques: ~ 10 cours Ph. Beaune, C. Beldjord, M. Delpech

* Protéines: ~ 5 coursM. Delpech, R. Barouki

* Enzymologie: ~ 4 coursJ-L. Pérignon, J.-C. Chottard

* Bioénergétique: ~ 2 coursD. Ricquier

* Biochimie et Médecine ~ 6 coursC. Beldjord, Ph. Beaune, R. Barouki

Biochimie fmp5 P1 2006 / 2007

* COURS BIOCHIMIE:début 22 janvier fin 29 mars

1 h 30 Doublés par les enseignants + vidéo dans 3 amphis* T.D.

exercices illustratifs + type concoursannales corrigéesdébut 5 février Fin: 6avril2 séances de 1 h. 30 par semaine 16 séances / étudiant

* POLYS- TD ( exercices)- COURS (diapos, plan, internet)

PROTEINES, ENZYMO, BM, BIOÉNERGÉTIQUE.

* SUJET CONCOURS simple sans piège, long, comme dans annales, QCM; sujet intégré le plus possible très probable

* PREPARATION MEDECINE Message simple, applications médicales, techniques

BIBLIOGRAPHIE* REVUES

- françaismédecine /sciencesPour la scienceLa recherche

- anglaisNatureScienceTIBS

* LIVRESne pas acheter* Biochimie et Biologie moléculaire B. Sablonnière

* Biochimie- Biochimie génétique (Etienne)- Atlas de biochimie- en anglais Devlin, ZubaiStryer, Lehninger

Plan général du cours

Structure de la matière

- composition- glucides- lipides- acides aminés / protéines- stucture des A.N.

Transfert de l’information: A.N. ---> Protéines

- Réplication- Réparation- transcription /maturation- traduction- post-traduction- régulation

Applications médicales

à la fin

Composition des êtres vivants

• Constituants % poids total

•Eau 70

• sucres (glucides) 3

• lipides 2

• protéines 15

• acides nucléiques 7

• ions oligo-éléments… 3

- Les différents constituants de la matière vivante

- Sucres- Lipides- Protéines- A. N.

Sucres-Glucides

- substances avec 1 C=0 (réducteur) et des C-OH hydrophiles

- monomères et polymères

- énergie (glucose, glycogène, amidon…)

- structure (matrice, cellulose…)

- Héparine

- glyco-protéines

Sucre à 3 carbones Sucres à 5 carbones

désoxyribosedésoxyribose

*

Glucose

Branchement

Osides

Cellulose (ß), amidon, glycogène

(Saccharose)

Liaison osidique ß 1-4

α 1-4 α 1-4 α 1-4

α 1-6

Sucres-Glucides

- substances avec 1 C=0 (réducteur) et des C-OH hydrophiles

- monomères et polymères

- énergie (glucose, glycogène, amidon…)

- structure (matrice, cellulose…)

- Héparine

- glyco-protéines

Cours Ph. Beaune

-Les différents constituants de la matière vivante

- Sucres- Lipides- Protéines-A. N.

Lipides

* substances insolubles dans l’eau et solubles dans les solvants organiques

* acides gras +

* énergie (stockage)

* structure, membrane

* transmission information (stéroïdes, prostaglandines, vitamine D…)

* Lipoprotéines

* Acide palmitique (C16)

* Acide stéarique (C18)

* Acide Oléique (C18:1, ω - 9)

Lipides

ω

1

1

1

Exemple de triglygéride, forme de stockage de l’énergie

Lipides

L’acide oléique avec sa courbure (double liaison)introduit une distorsion

ester

lipase

Lipides

Phospholipases

Acide Arachidonique (AA) C20:4

Acide rétinoïque (tout trans)

Ac. palmitique

Cours Ph. Beaune

-Les différents constituants de la matière vivante

- Sucres- Lipides- Protéines (acides aminés)

α-C R = Chaînelatérale

Liaison peptidique

20 amino-acidesdifférents

en fonction de R

Structure d ’un amino-acide

R

NH2 C COOH

H

Enchaînement d ’aminoacides

*

Structuresecondaire(α-hélice,feuillet ß…)

Structureprimaireenchaînement

Structure Tertiaire ---> fonction

Fonctions des protéines

dépendent de la structure

Tridimensionnelle

Structure trimensionnelle dépend

de la structure primaire

(enchaînement AA)

Les acides nucléiques sont unenchaînement de nucléotides

N

NN

N

NH2

O

HOH

HHHH

OP-OO-

O

dAMP

5’

3’

N

NN

NH2

O

OHOH

HHHH

OPO

O-

O

P-O

O-

O

PO

O-

O

αßγ

ATP

~ ~ 5’

3’

N

ADN enchaînement

N

NN

NNH2

O

O

HHHH

POO

O-

NH

N

NO

NH2N

OHH

HH OPOO

O-

OHH

HH

N

N

NH2

O

OPOO

O-

OHH

HH

HN

N

O

O

OH

A

G

C

T

5’P

3’OH

H

H

H

H

P- O

5’

5’3’

3’

ARN enchaînement

N

NN

NNH2

O

OHO

HHHH

POO

HO

O-

NH

N

NO

NH2N

O

OH

HHHH O

POO

O-

O

OH

HHHH

N

N

NH2

O

OPOO

O-

O

OH

HHHH

HN

N

O

O

OH

A

G

C

U

5’P

3’OH

P-O

Fonctions des protéines dépendent de la structure tridimensionnelle

Structure trimensionnelle dépendde la structure primaire (enchaînement AA)

Les AN ont une structure primaire qui permet de conserver et de transmettre l’information de l’enchaînement (séquence) des AA

ADN = contient, stocke et transmetl’information (AN---> AN)

ARN = transmet information (AN---> protéine)