LA CINETIQUE LOGIQUE Les gènes Hox. 1.Propriétés des gènes Hox 2.Réduction du modèle 3.Construction du modèle –Conventions –Modèle descriptif –Système.

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    04-Apr-2015

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  • LA CINETIQUE LOGIQUE Les gnes Hox
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  • 1.Proprits des gnes Hox 2.Rduction du modle 3.Construction du modle Conventions Modle descriptif Systme dquations 4.volution du systme Table de vrit littrale et valeurs des K i Fonctionnalit des boucles de rtroaction Pseudo-carte de Karnaugh Problmes 5.Vers une amlioration du systme
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  • Proprits des gnes Hox Gnes responsables de la dtermination de laxe antro-postrieur 1 re Notion : Combinaison 2 me Notion : Colinarit
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  • Rduction du modle Modle tabli partir de trois gnes
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  • Construction du modle Conventions: 1sa1sa 2sa2sa 1sb1sb 2sb2sb scsc 012 01 Variable mmoire: Concentration du facteur de transcription cod par le gne X Fonction logique: Synthse du facteur de transcription cod par le gne X
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  • Construction du modle Modle descriptif +2 cba +1
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  • Construction du modle Systme dquations: A = dA ( k aa. 1 a + k ba. 1 b ) B = dB ( k ab. 2 a + k cb.c ) C = dC ( k bc. 2 b ) +2 c b a +1
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  • volution du systme Table de vrit littrale et valeurs des K i :
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  • volution du systme Fonctionnalit des boucles de rtroaction : 3 boucles fonctionnelles 3 points caractristiques: 1 s a 00 2 s a 1 s b 0 2 2 s b 1 s c +1 a +2 ab +1 +2 bc
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  • volution du systme Condition: le dlai dactivation de la synthse du facteur de transcription cod par le gne X-1 par le facteur de transcription X est suprieur au dlai de dgradation des facteurs de transcription codes par les gnes X et X+1 Pseudo-carte de Karnaugh Exemple: 0+1-00+1-00+1-00+1-0 110 000
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  • volution du systme Problmes: 0 + 21 1 + 21 221 0 + 2 - 0 + 1 + 2 - 0 + volution incorrecte
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  • Vers une amlioration du systme Raliser des expriences permettant de dfinir des dlais Autre modle possible: Condition: lexpression du gne X+1 ncessite lexpression du gne X Systme dquations: A = dA ( k aa. 1 a + k ba. 1 b. 2 a) B = dB ( k ab. 2 a + k ab+cb. c. 2 a) C = dC ( k bc. 2 b ) Pseudo-carte de Karnaugh
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  • Conclusion Multistationnarit Phnomne biologique: la diffrenciation Reprsentation caricaturale
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  • c 1sc1sc a b 1sa1sa 2sa2sa 1sb1sb 2sb2sb 0001002-0+02-0+0 210 22 - 0 + 1+1-01+1-0 1+2-0+1+2-0+ 0+1-00+1-0 0+2-0+0+2-0+ 00 + 1 - 0+1+1-0+1+1- 0 + 21 10 + 1 - 2-0+1-2-0+1- 21 + 1 - 1+1+1-1+1+1- 1 + 21221 Pseudo-carte de Karnaugh
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  • c b a 000/000010/000020/000 001/000011/000021/000 110/100100/100120/100 101/100111/100121/100 200/110210/210220/211 201/110211/210221/221 2sb2sb 1sc1sc 1sa1sa 2sa2sa Pseudo-carte de Karnaugh

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