L’amélioration génétique dans l’élevage laitier

Méthodes d’indexation : les principes

Indexer = estimer la valeur génétique des animaux à partir de deux types d’information, les performances mesurées et les généalogies.

la base de tout protocole d’évaluation génétique : identification des animaux, leur filiation et le contrôle de leurs performances

L’index = meilleure estimation de la valeur génétique d’un reproducteur ( valeur génétique la plus probable)

L’INEL en France

Une méthode internationalement reconnue pour des index fiables : (depuis mars 1990)– 5 index élémentaires :

• Quantité de lait (QL) : en kg• Quantité de matière grasse (MG) : en kg• Quantité de matière protéique (MP) : en kg• Taux butyreux (TB) : en ‰, ou en g/kg• Taux protéique (TP) : en ‰, ou en g/kg

– 1 index synthétique = combinaison des 5 index• INEL INdex Economique Laitier• INEL = 1,15 (MP + 3TP)

L’INEL en France fondée sur une méthode « BLUP appliquée

au modèle animal » BLUP = Best Linear Unbiased Predictor

(meilleur prédicteur linéaire non biaisé) Méthode statistique complexe : permet

l’analyse simultanée des effets de milieu identifiées et des effets génétiques

«modèle animal» : considération de l’individu qui réalise la performance (et non son père ou son grand-père maternel)

L’INEL en France

Avantage du « modèle animal » :– considération de toutes les relations de parenté– tous les individus pris en compte et formules de

calcul identiques pour tous les animaux comparaison directe

– prise en compte des effets de la sélection passée– tient compte des accouplements raisonnés– autres sources de biais également prises en

compte

L’INEL en France

L’index de valeur génétique d’un animal exprime sa valeur en tant que reproducteur.

La somme de l’index de valeur génétique et de la valeur individuelle non transmissible (A + V) exprimerait quant à elle la valeur de l’animal en tant que producteur.

L’ISU Intégration des caractères fonctionnels et

morphologiques dans l’INEL : 04/02 ISU (Index de Synthèse Upra) : il traduit l’objectif

de sélection d’une race et est défini au sein de l’UPRA (unité nationale de Promotion de la Race)

Les caractères d’intérêt économique ajoutés :– Fertilité femelle– Comptage cellulaire– Longévité fonctionnelle résiduelle– Format ou développement

L’ISU

Fertilité femelle :– action sur les réformes pour infertilité, sur

l’intervalle vêlage-vêlage, et donc sur la production par lactation et le nombre de veaux par an, et sur les frais d’insémination

– sa corrélation génétique avec la production laitière est négative(rg =-0.37).

L’ISU

Les comptages cellulaires (CEL) :– mesure indirecte de la résistance aux

mammites (corrélation génétique entre fréquences de mammites cliniques et comptages cellulaires est 0.70)

– liaison génétique entre comptages cellulaires et quantité de lait défavorable (rg = 0.20)

L’ISU

La longévité fonctionnelle résiduelle :– correspond aux réformes dues aux causes

autres– liaison génétique entre longévité

fonctionnelle (LGF) (normalement insensible aux réformes dues à l’insuffisance de production) et la production au travers de l’INEL pratiquement neutre

L’ISU

Le format ou développement :– avec sa conséquence sur le poids de

l’animal, il est lié directement au produit viande et aux besoins d’entretien

– la taille des animaux et leur capacité corporelle semblent quasi indépendantes de la production laitière (rg = 0.10)

L’ISU Estimation de leur valeur économique

marginale = somme des conséquences d’une élévation du niveau génétique d’une unité du caractère considéré pris isolément pour une femelle du troupeau

Cette somme de conséquences est mesurée sur la carrière de cette femelle et ramenée ensuite à la marge nette de l’exploitation.

Le gain génétique en production participe pour environ 50 % à l’amélioration de la marge nette de l’exploitation

Indexation Scandinave : inclusion des caractères de reproduction et de santé Problèmes concernés : taux cellulaires, taux de

mammites, pathologies de l’appareil locomoteur, fertilité, vêlage dystocique et mortalité périnatale

Sources d’information pour leur intégration : bases de données existantes depuis les années 60

Etude sur une population de vaches rouges (Suédoise rouge et blanche – SRB) et de vaches pie-noires holsteinisées (SLB) : 2 x 700 000 vaches et 2 x 450 taureaux d’IA

Indexation Scandinave : inclusion des caractères de reproduction et de santé

durant les 3 dernières décennies :– SRB : échange uniquement entre populations

scandinaves (+2700 kg de lait)– SLB : holstéinisation internationale (+3000 kg)gain de production supérieur des SLB

Une observation : faible héritabilité des caractères de fertilité et de pathologies (<5%)

Indexation Scandinave : inclusion des caractères de reproduction et de santé

But de cette étude : mettre en relation productivité, méthodes d’évaluations génétiques, sélections pratiquées et réponses observées (en considérant les caractères de fertilité, de vêlage et de mammites)

Indexation scandinave : 1. la fertilité femelle

Mesures pour deux caractéristiques différentes :– intervalles vêlage-1ere ou dernière insémination – taux de gestation par rapport au nombre d’inséminations

Variation génétique : – Faible héritabilité (2-3 %)– Grande variation génétique additive (6-9 %)– Corrélation génétique de fertilité entre les catégories

d’âge :• Très haute chez les vaches• Régie différemment chez les génisses (gènes partiellement

différents)

Indexation scandinave : 1. la fertilité femelle Evaluation génétique :

– Conséquence de la faible héritabilité sélection des taureaux sur base de progeny test (grand nb de filles)

Sélection et réponse :– TMI : Total Merit Index (tous les pays

nordiques) incluant la fertilité femelle

Indexation scandinave : 1. la fertilité femelle

Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage Collecte des dates de vêlages, du taureau utilisé,

de l’état du veau à la naissance, d’un score de performance au vêlage et des pedigree des parents

Variation génétique :– Héritabilité faible des caractères de vêlage

– Variation génétique additive plus importante

– Taux de mortalité périnatale• au 1er vêlage : grande disparité entre les races

• chez les vaches : différences minimes

• Variation génétique indépendante du type de vêlage

Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage Evaluation génétique :

– Compliqués à définir malgré une apparente facilité d’observation (intéraction de 2 générations)

– Variation considérable entre les génisses et les vaches

– Nombreuses études biaisées par une population unique de primipares (différence flagrande avec les pluripares)

Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage

Sélection et réponse :– Dystocie et mortalité périnatale incluses dans le

TMI– Une hypothèse : propagation d’un gène récessif

provoquant une malformation vertébrale chez les Holstein (graphe)

Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage

Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites

Problème le plus coûteux dans la production laitière

Mêmes bases de données que les précédentes pour les cas cliniques de mammites

Utilisation du compte de cellules somatiques comme outil de gestion

Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites Variation génétique :

– Héritabilité basse pour les cas cliniques (CM) 2-5%

– Héritabilité variable entre 8 et 15 % pour le SCC

– Correlation génétique entre CM et SCC : 50 - 80 %

– Rapport défavorable entre la production et la sensibilité à la mammite

Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites

Variation génétique :– Absence de sélection des taureaux sur le critère

SCC– Progrès réalisé sur lesvaches en première

lactation (graphe)

• Sélection et réponse :

– Grande importance des caractéristiques des mammites dans l’élaboration du TMI

Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites

Indexation scandinave : 4. Total Merit Index

Début d’application en Norvège et en Suède Inclus tous les paramètres vus jusqu’à

présent Contribue à un gain économique de 10 à 25

% par rapport au simple caractère de production

Indexation scandinave : Conclusion Adoption unanime des autres pays de

l’attitude scandinave car : – Développement de bases de données similaires– Intérêt croissant du public pour le bien-être

animal

Nécessité d’une harmonisation sur la définition et les modèles d’évaluation génétique des caractères

Bibliographie

Philipsson J., Lindhé B. Experiences of including reproduction and health traits in Scandinavian dairy cattle breeding programmes, Livestock production science 83 (2003) 99-112

http://www.inst-elevage.asso.fr/html1/rubrique.php3?id_rubrique=507

http://res2.agr.gc.ca/lennoxville/activ/informatise-computerized_f.htm

http://dga.jouy.inra.fr/sgqa/equipes/bl.htm http://www.agrireseau.qc.ca/bovinslaitiers/ http://www.web-agri.fr/infos/dossiers/31_01_02_taureaux

Travail réalisé par :– Camus Stéphan– Ceysens Nicolas– Charbonneau Alexandre

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