Licence Biologie-Biochimie - Troisime Biologie-Biochimie...de biologie vgtale et de biochimie d'o rir une formation originale dans ce domaine. ... Aprs examen des dossiers par la commission d'quivalence.

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    07-Feb-2018

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Licence Biologie-Biochimie -Troisime anneParcours Biologie Gnrale et Sciences dela Terre (BGST)Livret de ltudiant2013-2014Licence Biologie-BiochimieInformations gnralesOlivierRichardolivier.richard@univ-orleans.fr(Secrtariat)+33238417099Directeur des tudesDans le cadre de l'harmonisation europenne des cur-sus universitaires (rforme LMD Licence-Master-Doctorat), lesmentions de Licence sont constitues de 6 semestres.Parcours et objectifsLa licence mention Biologie Biochimie a pourobjectifs de :- former un public tudiant toutes les disciplines de labiologie : biologie gnrale animale et vgtale, biologie cellulaire et molculaire, gntique formelleet des populations, physiologie animale et physiologie vgtale, biotechnologies, cologie, biologiedes organismes et des populations.- lui permettre ainsi d'acqurir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3dans tous les secteurs techniques et scientiques des Sciences de la Vie, ces connaissances tantindispensables une poursuite d'tudes vers les Masters Recherches et Professionnels ou l'int-gration dans le monde professionnel dans ce domaine.- prparer au concours du CAPES Sciences de la Vie et de la Terre, via une insertion dans unMaster de prparation au concours du CAPES (exemple le Master MED-SVT d'Orlans)- prparer au concours pour le Professorat des coles, via une insertion dans un Masterde prparation au concours (exemple le Master MEEFA ESPE d'Orlans) mettre dispositionles savoirs et les connaissances existants l'Universit d'Orlans dans le domaine des Sciencesbiologiques.La licence mention Biologie Biochimie est organise en 5 parcours : Le parcours Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystmes (BOPE)s'intgre dans le contexte actuel de l'essor des disciplines de l'cologie de la biodiversit etde l'tude de l'environnement. Ce parcours permet aux tudiants d'approfondir leurs con-naissances sur les inter-relations des tres vivants, animaux ou vgtaux, ainsi que les liensavec leur environnement. Les mcanismes adaptatifs, volutifs, physiologiques et gntiquesseront abords au niveau des organismes et des populations. Pour ce faire, au-del des con-naissances thoriques, des tudes sur le terrain et en laboratoire, intgrant les outils modernesde la biologie molculaire sont proposes. Le parcours Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC) est destin aux tudiants voulant1aborder le monde vivant, par ses aspects physiologiques, cellulaires et molculaires. Ceparcours permettra aux tudiants d'acqurir des connaissances en biologie molculaire, enbiochimie structurale, en gntique, en biochimie, en biophysique en physiologie humaine etanimale et en immunologie. Les aspects pratiques permettront aux tudiants d'acqurir uneinitiation au travail en laboratoire dans ces dirents domaines. Un choix d'option de chimieen semestre 6 peut aussi permettre l'tudiant d'acqurir des connaissances spciques lachimie bioorganique. Le parcours Biologie et Biochimie du Vgtal (BBV) est spcialement conu pour lestudiants intresss par le monde vgtal et souhaitant se former de faon large aux disciplinesde la physiologie vgtale, de la biologie molculaire et des biotechnologies vgtales, ainsiqu' l'cologie. Il recouvre ainsi partiellement les parcours BOPE et BMC. Ce parcours qui at ouvert aux tudiants durant le contrat prcdent a montr qu'il correspondait parfaitementaux attentes des tudiants vgtalistes . Il permet par le jeu de la mutualisation des unitsde biologie vgtale et de biochimie d'orir une formation originale dans ce domaine. Le parcours Biologie Gnrale et Sciences de la Terre (BGST) permet aux tudiantsd'approfondir leurs connaissances dans les domaines de la biologie et de la gologie pour treen adquation avec les programmes du concours CAPES-SVT. Le programme du CAPEStant trs vaste, ce parcours apportera une partie des connaissances ncessaires l'tudiant,le complment tant trait durant la premire anne du Master enseignement propos Orlans. Le parcours Pluridisciplinaire (PLURI) s'adresse aux tudiants souhaitant obtenir unniveau Bac+3 an de postuler aux concours de la fonction publique d'une part, mais surtoutintgrer les Master prparant au concours de professorat des coles (comme celui propospar l'ESPE d'Orlans-Tours). Pour ce faire, des enseignements scientiques seront compltspar des units de mathmatiques, de franais et d'anglais et des enseignements proposs parl'ESPE.Conditions d'admissionSemestre 5 : Pour les tudiants inscrits dans le cursus, avoir obtenu au moins un des semestresde premire anne de licence.Pour les tudiants provenant d'autres cursus (Prpa, classes BTS, IUT. . . .) : Aprs examen desdossiers par la commission d'quivalence.Orientation et rorientationL e choix du parcours en L3 se fera lors de la runion de pr rentre ou dans les jours quisuivent cette runion. L'tudiant pourra tre aid dans son choix par les directeurs des tudes.Un changement de parcours reste possible entre les semestres 5 et 6. Toutefois la dnominationd'un parcours ne pourra tre inscrite sur le supplment au diplme si les semestres 5 et 6 obtenuspar l'tudiant n'appartiennent pas au dit parcours. L'tudiant obtiendra donc la Licence mentionBiologie-Biochimie (sans spcialit ou parcours prcis)GlossaireUnits d'enseignement :Ensemble d'enseignements comprenant des cours, TD, TP ou autres travaux personnels. Chaqueunit est aecte d'ECTS et fait l'objet d'un contrle de connaissances.Units d'ossature : units d'enseignement obligatoires correspondant la formation de l'tudi-ant dans la licence pour le parcours choisi.Units optionnelles : units choisir dans une slection d'units proposes pour personnaliserson parcours.Units libres : UE permettant l'tudiant de complter sa formation (culture gnrale,mthodologie universitaire, lments de professionnalisation, stages, complments de langue,utilisation des ressources documentaires. . . ). Units choisir dans le livret des UE libres del'ensemble des composantes de l'Universit.Crdits ECTS (European Credits Transfer System = Systme Europen deCrdits de Transfert) A chaque unit d'enseignement (UE) est aecte une valeur en crdits qui correspond auvolume du horaire de l'unit. Les crdits sont attribus quand l'unit est valide (note > ou= 10/20). Chaque semestre valid correspond 30 crdits. Une licence correspond donc 180 crdits(6 semestres). Ces crdits reprsentent une monnaie d'change et sont : Transfrables dans toute autre universit europenne ; Capitalisables c'est--dire dnitivement acquis quelle que soit la dure du parcours del'tudiant.Grade :Les grades universitaires sanctionnent les divers niveaux de l'enseignement suprieur. Depuis ledcret du 8 avril 2002 ce sont : le baccalaurat, la licence, le master et le doctorat.Diplme :A chaque grade correspond un titre ou un diplme. Sont conserves les possibilits de dlivrerdeux diplmes intermdiaires, ne correspondant pas un des grades prcdents : celui de matrise (correspondant aux 60 crdits ECTS des semestres 1 et 2 de master) (article 9 de l'arrt du 25 avril 2002 relatif au diplme de master), celui de DEUG (correspondant aux 120 crdits ECTS des semestres 1, 2, 3 et 4 de licence) (article 2 de l'arrt du 23 avril 2002 relatif aux tudes universitaires conduisant au gradede licence).Ces deux derniers diplmes sont dlivrs dans la mention retenue sans indication deparcours ou de spcialit, mais accompagns d'un supplment au diplme .Supplment au diplme(dcret du 8 avril 2002 portant application au systme franais d'enseignement suprieur de laconstruction de l'Espace europen de l'enseignement suprieur. Art. 2). C'est une annexe descriptiveau diplme, destine assurer la lisibilit des connaissances et aptitudes acquises dans le cadre dela mobilit internationale.Equipe de formation :Chaque mention de licence ou master est pilote par une quipe de formation qui veille l'adquation de l'organisation des tudes avec les objectifs xs, organise l'valuation gnrale desformations et labore un bilan annuel de la formation.Conseil de Perfectionnement :Equipe de formation largie des reprsentants tudiants lus et des personnalits du monde dela recherche acadmique, du monde de l'entreprise et des enseignants en lyce (classes du secondaireet de BTS). Runi une fois par an, ce conseil, la lecture des valuations de la formation, fait voluerla licence pour l'adapter au monde socio-conomique, de la recherche et aux formations antrieures.Directeur des tudes :En contact direct avec les tudiants et la scolarit de l'UFR, il anime l'quipe pdagogique.Jury :Constitu pour chaque semestre et prsid par le Directeur des tudes, il a en charge le recueildes notes, l'tablissement des moyennes et la validation du semestre. Un jury d'anne runi aprschaque session a en charge la dlivrance de l'anne et pour la L3 la dlivrance nale du diplme.Compensations : Pour chaque semestre, si la note globale moyenne est suprieure ou gale 10/20, le semestreest valid et lui sont associs 30 ECTS. La compensation annuelle s'organise ds la premire session entre les deux semestres cons-cutifs d'une mme anne universitaire : soit le semestre 5 avec le semestre 6.Notes liminatoires :Pas de note liminatoire en licenceLe semestre 5Maquette des enseignementsParcours Biologie gnrale et Sciences de la TerreIntitul ECTS CM TD TPOssature30ECTSBiodiversit 5 4 4 40Bases anatomiques des grandesfonctions animales3 14 10Evolution et adaptation des an-giospermes4 16 10 10Anglais 5 3 24Croissance et dveloppement desvgtaux4 24 12Chanes et bassins 4 20 28Embryologie et phygiologie animales 3 24 12Petrologie endogne II 4 24 12 24Dtail des enseignementsSOL5BO01 BiodiversitDurei1 48 hCours 4 hTD 4 hTP 40 hSemestre 5Objectifs+ Permettre ltudiant dedcouvrir desmilieux naturels denotre rgion,participer linventaire de lafaune et de la florepar la ralisationdun herbierpersonnel et duneboite de rfrencedinsectes.Langue(s)FranaisParcours BOPE / BBV / BGSTResponsables Christiane Depierreux christiane.depierreux@univ-orleans.frGraldine Roux geraldine.roux@univ-orleans.frPr-requis Bases en systmatique des arthropodes, en cologie des peuplements et enmorphologie et reproduction des plantes.Contenu Inventaire et diversit taxonomique des principaux groupes danimaux. Floristique etsystmatique du monde vgtal. Clefs pour la dtermination des taxons rencontrs.Mesure des indices de diversit. Observations sur le terrain (un groupe TP terrain encadr par deux enseignants) etanalyses en laboratoire (TP)valuation5Coefficient 5ECTSMthode dvaluation :Ecrit/Oral/TPModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CC(Animal/Vgtal) + CT (oral vgtal/crit1h + oral Animal) Session de rattrapage : RNE et RSE : CT OralCalcul de la note finale : Premire session : 50% CC + 50% CT Session de rattrapage : 50% Animal + 50% VgtalSOL5BO03 Evolution et adaptation des angiospermesDurei1 36 hCours 16 hTD 10 hTP 10 hSemestre 5Objectifs+ Acqurir lesconnaissances surlvolution etladaptation desplantes aux milieux.Langue(s)FranaisParcours BOPE / BBV / BGSTResponsable Christiane Depierreux christiane.depierreux@univ-orleans.frPr-requis Notions dorganisation, danatomie et de reproduction des embryophytes.ContenuEvolution et adaptation des vgtaux au milieu : Complments sur la reproduction et lvo-lution de lappareil reproducteur des angiospermes. Notions de classification. Adaptationsmorphologiques et anatomiques des vgtaux aux diffrentes contraintes environnemen-tales. Perception des signaux de contrainte : lumire, temprature, gravit...valuation4Coefficient 4ECTSMthode dvaluation :Ecrit/TPModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : Ecrit (CT) 2h + TP (CC+CT) 1h30 Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit (CT) 1h30 + TP (CT) 1h30Calcul de la note finale : Premire session : 66% Ecrit + 33% TP Session de rattrapage : 66% Ecrit + 33% TP1SOL5BO05 Bases anatomiques des grandes fonctions animalesDurei1 24 hCours 14 hTP 10 hSemestre 5Objectifs+ Acquisition delanatomie et delhistologie desgrandes fonctionsavantdapprhender laphysiologie.Langue(s)FranaisParcours BOPE/ BMC / BGSTResponsable Valrie Altemayer valerie.altemayer@univ-orleans.frPr-requis Avoir de bonnes bases en biologie cellulaire.Contenu Cours : Organisation des tissus : tissus pithliaux conjonctifs musculaires. De-scription anatomique et histologique des appareils : circulatoire respiratoire digestifexcrteur. TP illustration du cours partir de prparations et de coupes histologiques Etude delorganisation de tous les appareils prsents en cours chez une souris. Les TP pourronttre enseigns en anglais.valuation3Coefficient 3ECTSMthode dvaluation :Ecrit/OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CT (Ecrit) 1h30 Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (Oral) 15 minCalcul de la note finale : Premire session : 100% Session de rattrapage : 100%SOL5AG35 Anglais 5Durei1 24 hTD 24 hSemestre 5Objectifs+ Comprendrelinformationexprime dans desmessages complexessur le domaine desSciences etTechnologies etsexprimer sur cemme domaine lcrit dans unregistre de langueappropri.Langue(s)FranaisAnglaisParcours BOPE / BMC/ BBV / BGST / PLURIResponsable Herv Perreau herve.perreau@univ-orleans.frPr-requis Avoir suivi Anglais 3 + 4 ou environ 500 heures de formation quivalente.ContenuTravail de comprhension et dexpression partir de documents authentiques longs et/oucomplexes, portant sur des innovations technologiques, des dcouvertes ou avances sci-entifiques.valuation3Coefficient 3ECTSMthode dvaluation :EcritModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE : CC 3h ; RSE : CT 1h30 Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h30Calcul de la note finale : Premire session : 100% Session de rattrapage : 100%2SOL5BO06 Croissance et dveloppement des vgtauxDurei1 36 hCours 24 hTP 12 hSemestre 5Objectifs+ Acquisition desconnaissances debase de laphysiologie dudveloppement desplantes.Langue(s)FranaisParcours BOPE / BBV / BGSTResponsable Daniel Hagge daniel.hagege@univ-orleans.frContenuLes phytohormones (les principales familles, biosynthse et dgradation, transport, rlesphysiologiques, utilisations pratiques) - La graine : de la mise en rserve la mobilisation -La germination - La floraison (vernalisation, photopriodisme, thermopriodisme, thoriesde la floraison, morphogense florale)valuation4Coefficient 4ECTSMthode dvaluation :Ecrit/TPModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE : Ecrit CT 2h / TP CC ; RSE : Ecrit CT 2h / TP CT 1h Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit/TP CT 2h/1hCalcul de la note finale : Premire session : Ecrit 66% + TP 33% Session de rattrapage : Ecrit 66% + TP 33%RfrencesHeller et al.-T1 et 2 (Dunod) ; Mazliak et al. (Hermann) ; Laval-Martin et Mazliak (Her-mann) ; Guignard- Biochimie vgtale (Dunod 2000) ; Luttge, Kluge et Bauer, Botanique(Tec et Doc 1996) ; Anderson-Beardall : Molecular activities of plant cells. (Blackwell Sci-entific Pub.) ; Campbell : Biologie (De Boeck Universit) ; Nultsch : Botanique gnrale(De Boeck Universit) ; Taiz and Zeiger : Plant physiology (Sinauer) ; Buchanan, Gruissemand Jones, Biochemistry and molecular biology (Amer. Soc. Plant Physiol.)3SOL5GO01 Chanes et bassinsDurei1 48 hCours 20 hTP 28 hSemestre 5Objectifs+ Cette unitapporte unedescription dtailledes grands types dechanes demontagnes et desbassinssdimentaires. Ellepermet lacomprhension delarchitecture desorognes dans leurscadresgodynamiques etcelle de la place desaccumulationssdimentairesavant, pendant etaprs la tectoniqueet des mcanismesresponsables de laformation de cesobjets.Lenseignementmagistral estcomplt parlapprentissage de lacartographie et deltablissement decoupes gologiqueset de schmasstructuraux diverses chelles. Ilaboutit lacquisition demthodesgologiquesdtudes dobjetsgologiques commeune chane demontagnes ou unbassin.Langue(s)FranaisResponsable Michel Faure michel.faure@univ-orleans.frPr-requis Bases de la gologie structurale dans les diffrents niveaux structuraux. Bases dela tectonique des plaques. Analyses gomtriques, cinmatiques et dynamiquesdes dformations ductiles et fragiles. Bases en ptrologie endogne et exogne.Bases en gophysique : sismologie, sismique, magntisme, gravimtrieContenuCours. Chanes intracontinentales, de subduction, dobduction et de collision. Accr-tion et collage. Rgimes thermiques et dformations de la crote continentale ; liaisontectonique-mtamorphisme ; "metamorphic core complexes" ; exhumation syn- et post-collision. Bassins intracontinentaux en extension et coulissement, grabens et hmigrabens,bassins davant-pays et intramontagneux. TP. Cartographie diffrentes chelles : coupesgologiques (plis, nappes, chevauchements) ; schmas structuraux ; analyse de cartes Dansle cadre des activits de travail personnel non-prsentiel, il est demand de prparer unexpos par groupe de 2 ou 3 tudiants portant sur lanalyse critique dun article scien-tifique. Il sagit pour les tudiants de lire un article court en anglais traitant dun pointmoins approfondi du cours ou dun exemple de chane ou de bassin non trait. Ils doiventen extraire les grandes ides et les restituer oralement leurs collgues. A la suite delexpos, lenseignant intervient pour corriger les points mal compris ou apporter dautresprcisions.valuation4Coefficient 4ECTSMthode dvaluation :Ecrit/OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : Ecrit CC 2x2h / Rapport stage Session de rattrapage : RNE et RSE :CT 2h / Oral 30 minCalcul de la note finale : Premire session : 66% Ecrit + 33% Rapport Session de rattrapage : 66% Ecrit + 33% Oral4SOL5BO15 Embryologie et physiologie animaleDurei1 36 hCours 24 hTP 12 hSemestre 5Objectifs+ Physiologie :Connaissance dufonctionnement desbiomembranes, dela signalisationnerveuse et de laphysiologie descellules excitables,introduction auxtechniquesdlectrophysiologieet ltude descanaux ioniques etdes courantstransmembranaires.Connaissance enneuro-antomie etdu fonctionnementdu systme nerveuxcentral.+ Embryologie :Connaissance desgrandes lignes dudveloppementanimal. Acqurir unesprit synthtiqueafin de gnraliserla majorit desphnomnestudis.Langue(s)FranaisResponsables Jean-Pierre Gomez jean-pierre.gomez@cnrs-orleans.frClineMontcot-Dubourg celine.montecot-dubourg@univ-orleans.frPr-requis Physiologie : Connaissances sur la biologie cellulaire (structure de la cellule et delamembrane plasmique). Embryologie : connatre les principaux groupes durgne animalContenuPhysiologie cellulaire (14h) : Les cellules du systme nerveux. Le fonctionnement descellules excitables (cellules nerveuses, cellules musculaires stries et lisses). Etude du rlede la membrane plasmique et des changes membranaires passifs et actifs dans le fonc-tionnement de la cellule excitable. Le potentiel daction neuronal et la propagation delinformation nerveuse et neuro-musculaire. Le couplage excitation-contraction des mus-cles stris et lisses. La neurotransmission (neurotransmetteurs, rcepteurs membranaires,la synapse). La physiologie cardiaque : organisation gnrale du tissu cardiaque au niveaumacroscopique et microscopique (cardiomyocytes). Etude de lactivit lectrique au niveaucellulaire (le tissu pacemaker, le tissu conducteur, les potentiels daction) et global (llec-trocardiogramme). Lactivit mcanique cardiaque (le couplage excitation-contraction, larvolution cardiaque). Embryologie (10h) : Segmentation. Gastrulation. Neurulation chezdiffrentes espces animales. Embryologie humaine. Dveloppement des grandes struc-tures chez lembryon et le foetus humain. Quelques aspects de physiologie foetale. TP :Sances de TP interactives illustrant les notions de cours avec application lenseigne-ment secondaire.valuation3Coefficient 3ECTSMthode dvaluation :Ecrit/oralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CT (CM+TP)crit 2h + oral (CM+TP) Session de rattrapage : RNE et RSE : CT oral (CM+TP)Calcul de la note finale : Premire session : Ecrit 50% + oral 50 % Session de rattrapage : Oral 100%5SOL5GO03 Ptrologie endogne IIDurei1 60 hCours 24 hTD 12 hTP 24 hSemestre 5Objectifs+ Connatre lesmodes de mise enplace magmatiques.Connatre lestextures etstructures desrochesmagmatiques.Connatre les sriesmagmatiques dansleursenvironnementsgodynamiques.Matriser le choixduradiochronomtreappropri au modede mise en place.Matriser lesprincipes de lagochimie appliqusau magmatisme.Apprhender lemtamorphismecomme unphnomnedynamique.Interprter lestexturesmicroscopiques entermes desuccessionsparagntiques.Reconstituer destrajets P-Tapproximatifs.Langue(s)FranaisResponsable Nicole Le Breton nicole.le-breton@univ-orleans.frPr-requis Minralogie (S2) Sdimentologie et ptrologie sdimentaire (S3) Ptrologieendogne I (S4).ContenuPtrologie magmatique. Cours : Mise en place des roches volcaniques et plutoniques ;le magmatisme dans son cadre godynamique, les grandes sries magmatiques TD : dia-grammes de phases ; bilans de masse, principes et modles gochimiques TP : descriptionmacroscopique et microscopique des grands types de roches magmatiques Ptrologiemtamorphique. Cours : Approche dynamique du mtamorphisme : trajets P-T, volu-tions minralogiques et texturales, lien avec le cadre godynamique Les migmatites :caractristiques, modes de formation, lien avec le mtamorphisme au sens strict Les dif-frents mtamorphismes observs dans les Alpes. TD : Reprsentation des compositionsde minraux et desparagenses dans les diagrammes triangulaires ACF, AKF et AFMUtilisation des diagrammes AFMpour suivre les volutions paragntiques des mtaplitesdans diffrents contextes godynamiques Construction et exploitation de chemins P-Ten utilisant les rsultats demodles numriques TP : Etude microscopique de quelquesparagenses des mtaplites et des mtabasites Travail sur les facis mtamorphiqueset sur la reconstitution grossire de chemins P-T.valuation4Coefficient 4ECTSMthode dvaluation :Ecrit/OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : Cours/TD : CC (2h+2h - coeffs 1/1) ; CT : Oral15 min. TP : CC (1h30+1h30 - coeffs 1/1) Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(Cours 2h / Oral 15 min / TP 3h)Calcul de la note finale : Premire session : Ecrit 50% + Oral 25% + TP 25% Session de rattrapage : Ecrit 50% + Oral 25% + TP 25%RfrencesBard (1990) : Microtextures des roches magmatiques et mtamorphiques. Masson ; Boninet Moyen(2011) : Magmatisme et roches magmatiques. Dunod ; Caron et al. (2003) :Comprendre et enseigner la plante Terre. Ophrys ; Nicollet (2010) : Mtamorphisme etgodynamique. Dunod ; Philpotts et Ague (2011) : Principles of Igneous and MetamorphicPetrology Cambridge University Press ; Pomerol et al. (2011) : Element de gologie.Dunod6Le semestre 6Maquette des enseignementsParcours Biologie Gnrale et Sciences de la TerreIntitul ECTS CM TD TPOssature30ECTSPhysiologie humaine et compare 5 34 14Anglais 6 3 24Biologie volutive et molculaire 5 28 12 8Stages naturalistes I :Faune marine - pdologie-hydrogologie4 48Gologie de la France 5 20 6 22Fixation de l'azote et agroconomievgtale5 24 4 20Mthodologie de la rdaction et del'analyse en Biologie et Gologie3 24Stages naturalistes II :Diversit des algues marinesCompl. 24Dtail des enseignementsSOL6BO06 Physiologie humaine et compareDurei1 48 hCours 34 hTP 14 hSemestre 6Objectifs+ Ce moduleprsente les notionsde base enphysiologie animaleet humainencessaires pourune comprhensiondes mcanismesphysiologiques chezlhumain.Langue(s)FranaisAnglaisParcours BOPE / BGSTResponsables Olivier Richard olivier.richard@univ-orleans.frJean-Pierre Gomez jean-pierre.gomez@cnrs-orleans.frPr-requis Bases anatomiques des grandes fonctions animales (semestre 5)ContenuCompartiments liquidiens de lorganisme. Hmatologie, bases dimmunologie. Physiolo-gie du systme respiratoire : aspects anatomo-fonctionnels et rgulations. Fonction-nement du systme digestif, cheminement de laliment de la bouche labsorption in-testinale. Physiologie du nphron. Physiologie osseuse et de lossification. Introductionaux neurosciences : organisation du cerveau, activits du systme nerveux central et p-riphrique, bases de physiologie sensorielle. Introduction lendocrinologie : organisationdune glande, physiologie hormonale. Physiologie de la reproduction : de la productiondes gamtes la naissance ; liens entre systme hypothamo-hypophysaire et gonades.Les travaux pratiques illustreront le cours sous formes dateliers exprimentaux, cer-taines des activits proposes pourront tre enseignes en anglais. Lorganisation gnraleanatomique de lanimal, ncessaire pour la comprhension des aspects physiologiques, seraillustre laide du modle murin.valuation5Coefficient 5ECTSMthode dvaluation :Ecrit/OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h (CM+TP)+ Oral 15 min Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Ecrit 2h (CM+TP)Calcul de la note finale : Premire session : E 66% + Oral 33% Session de rattrapage : 100%1SOL6BO02 Biologie volutive et molculaireDurei1 48 hCours 28 hTD 12 hTP 8 hSemestre 6Objectifs+ Apprhender lescontraintesphylogntiquesdans laclassificationvolutive desespces. Matriserles principalesmthodes dereconstructionutilises enphylogniemolculaire.Langue(s)FranaisParcours BOPE / BGSTResponsables Graldine Roux geraldine.roux@univ-orleans.frAlain Legrand alain.legrand@univ-orleans.frPr-requis connaissance des plans dorganisations des animaux et vgtaux.ContenuLa ralit de lvolution. Caractristiques et mcanismes biologiques de lvolution deslignes. Classification et phylognse : mthodes (cladistique, phntique) et principes dela reconstruction phylogntique (utilisation des logiciels PAUP, Mega). Notions dvo-lution des gnomes, dhorloge molculaire, de duplication et pertes de gnes, lmentsmobiles (transposons), transferts horizontaux de gnes. Techniques de biologie molcu-laire lies ltude des gnomes.valuation5Coefficient 5ECTSMthode dvaluation :EcritModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1h Session de rattrapage : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1hCalcul de la note finale : Premire session : E 75% + TP 25% Session de rattrapage : E 75% + TP 25%SOL6AG36 Anglais 6Durei1 24 hTD 24 hSemestre 6Objectifs+ Comprendrelinformationexprime dans desmessages complexessur le domaine desSciences etTechnologies etsexprimer sur cemme domaine loral avec un degrde spontanit etde fluidit (niveaueuropen B2).Langue(s)FranaisParcours BMC / BOPE / BGST / BBV / PLURIResponsable Herv Perreau herve.perreau@univ-orleans.frPr-requis Avoir suivi Anglais 5 ou environ 500 heures de formation quivalente.ContenuTravail de comprhension et dexpression partir de documents authentiques longs et/oucomplexes, portant sur des innovations technologiques, des dcouvertes ou avances sci-entifiques.valuation3Coefficient 3ECTSMthode dvaluation :Ecrit/OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE : CC 2h (crit/oral) / RSE : CT (crit) 1h Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (crit) 1hCalcul de la note finale : Premire session : 100% Session de rattrapage : 100%2SOL6BO17 Stages naturalistes : cologie du littoral-faune marine /Pdologie-HydrogologieDurei1 48 hTP 48 hSemestre 6Objectifs+ Apprentissage dela reconnaissancedorganismesanimaux en rapportavec la diversit etlcologie des sitesrencontrs lors dustage. Formation etprparation auxcarrires delenseignement.Prparation auxmtiers delenvironnement et la gestion descosystmes.+ Lobjectif de cemodule est de fairedcouvrir, lagodiversitrgionale ainsi queles ressourcesassocies (eau,gothermie,matriaux...).Savoir lire unpaysage, extrapolerles observations desurface au sous-sol,dcouvrir lesprincipauxrservoirs. Raliserune analyse critiquedes donnes.Langue(s)FranaisParcours BOPE / BGSTResponsables Graldine Roux geraldine.roux@univ-orleans.frGalle Prouteau gaelle.prouteau@univ-orleans.frPr-requis Connaissance des groupes taxonomiques du rgne animal. Bonne connaissancedes bases de Gologie niveau L1 scientifique.Contenu Faune Marine : trois journes en Normandie consacres aux organismes animaux de lazone intertidale, suivies danalyses et de dmonstrations au laboratoire. Ces tudes sefont sur la base dexcursions sur diffrents biotopes reprsentatifs du milieu (observa-tion des organismes et de lenvironnement, prlvements dchantillons) et sont axesessentiellement sur la faune marine, les insectes et les oiseaux. Elles permettent la miseen relation entre biodiversit et conditions du milieu. Les sances en laboratoire sontdes dmonstrations (systmatique, dissection, morphologie compare, etc...) partirdes chantillons rcolts. Dautres tudes sont ralises in situ afin de dterminer ladiversit, la rpartition et la quantification des organismes reprsentatifs des variationsdu milieu (salinit, dure dimmersion ou dmersion, nature du substrat...). Pdologie-Hydrogologie : sortie de terrain (6h) : Prsentation de la Gologie rgionale.Prsentation de la gologie du Loiret. Lithologie, succession stratigraphique et histoiregologique : calcaires de Beauce, sables de Sologne et alluvions de la Loire. Dcouvertedaffleurements cls et de phnomnes karstiques (effondrements, rsurgences,...). In-cidences sur la circulation des eaux souterraines et loccupation des sols. Visite destations de pompage et de pizomtre. Travaux pratiques en salle 6,5h Dcouvertedes principaux rservoirs de donnes sur le sous-sol et les ressources en eau souter-raine. Comment accder aux donnes, comment les utiliser ? Dcouverte dEduterre(ressources goscientifiques du BRGM pour lducation), et accs aux donnes surGoogle Earth. Ralisations de scnarii sur ltat des lieux de la Nappe de Beauce(quantit/qualit).valuation4Coefficient 4ECTSMthode dvaluation :OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : Animal : CT 30 min sur site ; Pdologie-hydrogologie : CC (Rapport) Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Oral 15 minCalcul de la note finale : Premire session : 50% Animal + 50 % Pdologie-hydrogologie Session de rattrapage : 100%3SOL6GO01 Gologie de la FranceDurei1 48 hCours 20 hTD 6 hTP 22 hSemestre 6Objectifs+ Ltude de lagologie de laFrance et delEurope doit treloccasion dillustrerdes conceptsdvelopps dansdautres modules.Lordrechronologique desdiffrents cyclespermet une analyseplus aise desvnements carlhritage desphnomnesanciens joue un rleimportant.Langue(s)FranaisResponsable Michel Faure michel.faure@univ-orleans.frPr-requis Bases en stratigraphie, gochronologie, ptrologie endogne et exogne,gologie structurale.ContenuLe visage actuel de lEurope et de la France : Grands ensembles gomorphologiques :domaine mditerranen (arcs tyrrhniens et gens ; bassins ocaniques), reliefs alpins,massifs cristallins palozoiques et prcambriens, grands bassins sdimentaires Lvolu-tion prcambrienne de lEurope : Les chanes ant-cadomiennes dEurope septentrionale(Scandinavie et les britanniques). La chane du Protrozoque suprieur : la chane no-protrozoque (cadomienne) en France. Lvolution palozoque en France et la formationdu socle de lEurope : Structure et volution de la chane varisque daprs ltude desprincipaux massifs franais : Ardenne, Massif Armoricain, Massif Central, Vosges. Aperusur les noyaux hercyniens des chanes alpines (Massifs cristallins internes et externes,zone axiale des Pyrnes, Maures, Corse) - Aperu sur les autres segments varisquesdEurope : Ibrie, Massif de Bohme - Les autres orognes palozoques en Europe : lachane caldonienne de Scandinavie et du Nord des les britanniques, lOural. Lvolutionmso-cnozoque de la France : Les accumulations sdimentaires des bassins parisien etaquitain : points communs et diffrences, cas du bassin du Sud-est - La formation deschanes alpines du Trias au Miocne infrieur : le rifting tthysien, structures et mtamor-phismes alpins. La chane pyrnenne et ses dpendances languedociennes et provenales.Formation et volution de la marge armoricaine Le rifting ouest europen daprs les ex-emples franais : fosss dAlsace, Bresse, Limagnes. La formation du Golfe du Lion et larotation du microbloc corso-sarde. Godynamique actuelle de la France : donnes de lagodsie (GPS), les mouvements actuels et la sismicit, la gravimtrie et ses anomalies degrande longueur donde vnements rcents : variations eustatiques, glaciations et vol-canismes quaternaires, la crise messinienne. TD/TP : Illustration du cours par lanalyse dedocuments : cartes topographiques et gologiques Ralisations de schmas structurauxet de coupes diffrentes chelles 1/50 000 ; 1/250 000 ; 1/106 tude de documentsgophysiques (par exemple cartes gravi/mag, profils ECORS et autres, mcanismes aufoyer, sismicit, flux de chaleur).valuation5Coefficient 5ECTSMthode dvaluation :Ecrit/Oral/TPModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CC(E) 2x2h + CT(O) 15min + CC(TP) Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(E) 2x2h + CT(O) 15min + CT(TP) 3hCalcul de la note finale : Premire session : 50% Ecrit + 25% Oral + 25% TP Session de rattrapage : 50% Ecrit + 25% Oral + 25% TP4SOL6BO05 Fixation de lazote et agroconomie vgtaleDurei1 48 hCours 24 hTD 4 hTP 20 hSemestre 6Objectifs+ Acquisition desconnaissances debase de laphysiologievgtales.Langue(s)FranaisParcours BGST / BBVResponsable Daniel Hagge daniel.hagege@univ-orleans.frContenuMtabolisme azot et fixation symbiotique. Du bl au pain- De la vigne au vin. Sor-ties : utilisation des farines boulangres ; laboratoire de recherche sur la qualit des bls ;entreprise vinicole.valuation5Coefficient 5ECTSMthode dvaluation :Ecrit/TPModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE : CT (Ecrit) 2h + CC (TP) ; RSE : CT (Ecrit 2h + TP1h) Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (Ecrit 2h + TP 1h)Calcul de la note finale : Premire session : E 66% + TP 33% Session de rattrapage : E 66% + TP 33%SOL6BO23 Mthodologie de la rdaction et de lanalyse en biologie-gologieDurei1 24 hTD 24 hSemestre 6Objectifs+ Apprendre rdiger un textescientifiquestructur. Seprparer despreuves crites detype concours.Langue(s)FranaisResponsable Stphane Maury stephane.maury@univ-orleans.frContenuApprendre et appliquer les outils et les mthodes pour analyser et commenter des docu-ments scientifiques et apprendre rdiger une synthse crite sur le modle des crits detype concours du CAPES SVT.valuation3Coefficient 3ECTSMthode dvaluation :EcritModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE : CC (4h x 2) ; RSE CT 4h Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 4hCalcul de la note finale : Premire session : CC1 50% + CC2 50% Session de rattrapage : E 100%5SOL6BO15 Stage naturalistes II : diversit des algues marinesDurei1 24 hTP 24 hSemestre 6Objectifs+ Identifier lesprincipales alguesdes cotes franaises.Raliser un alguier.Langue(s)FranaisUnit complmentaireResponsable Christiane Depierreux christiane.depierreux@univ-orleans.frPr-requis Connaissance des cycles biologiques des algues.ContenuEtude sur le terrain (3 jours) des macroalgues benthiques. Observation des algues dansleur milieu naturel, identification des chantillons rcolts par analyse en laboratoire.valuation0Coefficient 0ECTSMthode dvaluation :CC+rapport+OralModalits de contrle des connaissances : Premire session : RNE et RSE : CC(2) + CT Oral 30 min Session de rattrapage : RNE et RSE : Pas de session de rattrapage pour le terrainCalcul de la note finale : Premire session : CC 50% + CT 50%6

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