Rédiger les matériels et méthodes de l'article scientifique ?· chaque sous-section, rédigez un…

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    11-Sep-2018

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Article scientifique : matriels et mthodes http://coop-ist.cirad.fr Public cible : chercheurs 1 Rdiger les matriels et mthodes de larticle scientifique en 6 points 1. Les matriels et mthodes expliquent comment vous avez men votre exprience 2. Dcrivez les mthodes et citez les sources 3. Structurez la section Matriels et mthodes 4. Soyez attentif aux mthodes statistiques 5. Faites attention aux pratiques du journal 6. Publier les mthodes : cela se pratique de plus en plus Ouvrages et liens utiles 1. Les matriels et mthodes expliquent comment vous avez men votre exprience Aprs lecture de la section Matriels et mthodes (Materials and Methods, Experimental, Experimental Procedures, Methods, etc.), le chercheur de votre spcialit doit tre apte reproduire lexprience et critiquer la validit des rsultats. Dans cette section, vous dcrivez avec prcision les conditions de lexprience dans un ordre logique. Ce descriptif est limit aux lments permettant de comprendre ltude prsente dans larticle. Cest la section de larticle la plus facile crire. Elle peut tre rdige en plusieurs tapes : ds la conception de la recherche et la mise en place des essais - Caractristiques gnrales, protocole, objet de ltude, variables mesures, mthodes, techniques, appareils de mesure et dobservation en cours de recherche - Adaptation de protocole, vnements imprvus lanalyse des donnes - Traitements statistiques. vitez : les lments qui nont pas un lien direct avec lobjectif de ltude les rsultats, sauf sil sagit de rsultats de validation de la mthode sur un chantillon pralable loubli de tout lment permettant de reproduire lexprience. 2. Dcrivez les mthodes et citez les sources Les mthodes et techniques doivent tre appropries l'objectif de larticle. Il peut tre utile dexpliquer pourquoi vous avez choisi une mthode ou une technique plutt quune autre. http://coop-ist.cirad.fr/Article scientifique : matriels et mthodes http://coop-ist.cirad.fr Public cible : chercheurs 2 Pour dcrire des mthodes et techniques standard de mesure ou danalyse des chantillons : nommez-les par leur appellation normalise donnez la rfrence bibliographique source qui les dcrit prcisment si besoin, rsumez brivement. Si vous modifiez une mthode ou technique standard ou connue, nommez-la, donnez la rfrence bibliographique source et dcrivez la modification. Pour une mthode nouvelle, ou peu connue, ou jamais ou peu utilise dans la discipline : dcrivez-la avec prcision donnez la rfrence bibliographique source si elle existe si ncessaire, expliquez pourquoi elle est approprie votre tude. 3. Structurez la section Matriels et mthodes Les principaux lments de la section sont les suivants : caractristiques gnrales - Site gographique, mtorologie, date, etc. exprimentations -Protocole exprimental, ou modalits de lenqute ou de lexploration, dure, nombre de rptitions, population, chantillon, questionnaires, etc. chantillons prlevs, mthodes et techniques dchantillonnage observations effectues, variables mesures, mthodes et techniques dobservation, de mesure ou danalyse mthodes de traitement statistique des donnes. Pour dcrire le matriel vivant espce, varit, population cible, souche, etc. , soyez prcis et utilisez les dnominations normalises : noms latins, noms officiels, provenances. Pour dcrire les appareils, pensez donner les nom et adresse du fabricant, le numro de srie. Pour dcrire les produits phytosanitaires, mentionnez le nom gnrique (matire active) et si besoin la composition complte, le fabricant et la ville du fabricant, les quantits, les modes de prparation. Pour les ractifs et les produits pharmaceutiques, mentionnez aussi le numro de lot. Pensez illustrer vos matriels et mthodes : carte gographique, photographie ou schma de lexprimentation, dun appareil, du matriel vivant, etc. Pour expliquer des traitements, un tableau peut tre un bon moyen de structurer des descriptions rptitives. 4. Soyez attentif aux mthodes statistiques Dcrivez les tests statistiques et prcisez pour chacun les variables concernes. Dites clairement comment vous traitez vos donnes et dtaillez la rfrence exacte du logiciel utilis. Si celui-ci nest pas un outil courant, prsentez-le. Spcifiez lorigine de lincertitude : mme chantillon mesur plusieurs fois, un chantillon par rptition, cart-type, etc. http://coop-ist.cirad.fr/Article scientifique : matriels et mthodes http://coop-ist.cirad.fr Public cible : chercheurs 3 5. Faites attention aux pratiques du journal Reportez-vous aux conseils aux auteurs du journal pour les units, les nomenclatures, la forme de la section, les mentions dthique de la recherche. Si le journal autorise les sous-sections, utilisez-les. Elles simplifient lorganisation du texte. Pour chaque sous-section, rdigez un titre prcis et informatif par rapport son contenu. La position de la section dans larticle varie selon le journal : juste aprs lintroduction (position la plus courante) en fin darticle (de plus en plus frquent) - Matriels et mthodes dcrits aprs la conclusion de larticle, parfois dits en petits caractres dans le fichier de larticle tlcharger externe larticle - Matriels et mthodes dcrits dans un document supplmentaire (supplemental information) qui ne fait pas partie du texte de larticle ; cest un fichier ou une page web autonome, que le lecteur ouvrira ou non. La position en fin darticle ou en fichier externe a des consquences sur la rdaction de larticle : la fin de lintroduction peut apporter davantage dinformation sur les objets tudis, pour que le lecteur sache de quoi on parle en section Rsultats, sans avoir ouvrir un autre fichier (voir la fiche CoopIST : Rdiger lintroduction) en section Rsultats, au dbut de chaque paragraphe prsentant un nouveau rsultat, quelques mots peuvent rappeler la mthode. 6. Publier les mthodes : cela se pratique de plus en plus Mthodes, techniques et outils informatiques crs pour les recherches sont la partie cache de la science. Mais elle est de plus en plus mise en avant, pour trois raisons : il est difficile de faire de la science sans outils crs spcialement pour avancer dans les recherches et obtenir des rsultats novateurs le partage des donnes de la recherche (Open Data, Data Sharing) implique que les mthodes dobtention soient dcrites (voir les fiches CoopIST : Rdiger et publier un data paper ; Rendre publics ses jeux de donnes) la transparence des mthodes est un lment cl pour lutter contre la fraude scientifique. De nouveaux journaux ou de nouvelles rubriques (Protocol, Methodology, etc.) sont crs pour publier les mthodes ou les donnes associes leur mthode dobtention. Notez : un article publiant une mthode nouvelle doit apporter la preuve de son fonctionnement et de sa validit, par comparaison avec dautres mthodes, ou en montrant la pertinence des rsultats obtenus. Ouvrages et liens utiles Elsevier, Reviewer's quick guide to common statistical errors in scientific papers. http://www.elsevier.com/__data/promis_misc/ejvesstat.pdf Lichtfouse E. 2012. Rdiger pour tre publi ! Conseils pratiques pour les scientifiques. Springer-Verlag, Paris, 105 p. ISBN 978-2-8178-0288-6. http://coop-ist.cirad.fr/http://url.cirad.fr/ist/introductionhttp://url.cirad.fr/ist/data-paperhttp://url.cirad.fr/ist/data-paperhttp://url.cirad.fr/ist/rendre-publics-ses-donneeshttp://www.elsevier.com/__data/promis_misc/ejvesstat.pdfArticle scientifique : matriels et mthodes http://coop-ist.cirad.fr Public cible : chercheurs 4 PLOS One, 2015. Submission Guidelines. Materials and Methods. http://journals.plos.org/plosone/s/submission-guidelines#loc-materials-and-methods Pochet B. 2015. Lire et crire la littrature scientifique (2015). Presses agronomiques de Gembloux, 130 p. ISBN 978-2-87016-118-0. http://orbi.ulg.ac.be/handle/2268/109540 San Fransisco Edit, 2013. Twelve Steps to Writing an Effective Materials and Methods. http://www.sfedit.net/newsletters.htm Software Sustainability Institute, 2015. In which journals should I publish my software? http://www.software.ac.uk/resources/guides/which-journals-should-i-publish-my-software Taylor & Francis Author Services, 2015. Preparation. Methods. http://journalauthors.tandf.co.uk/preparation/writing.asp#link16 Zeiger M. 1999. Essentials of writing biomedical research papers. Second Edition. McGraw-Hill, USA, 440 p. ISBN 0-07-134544-2. Ccile Fovet-Rabot Dlgation linformation scientifique et technique, Cirad 29 septembre 2015 (mise jour) Informations Comment citer ce document : Fovet-Rabot, C. 2015. Rdiger les matriels et mthodes de larticle scientifique en 6 points. Montpellier (FRA) : CIRAD, 4 p. http://url.cirad.fr/ist/materiel-methode Cette uvre est mise disposition selon les termes de la Licence Creative Commons : Attribution - Pas dUtilisation Commerciale - Partage dans les Mmes Conditions 4.0 International, disponible en ligne : http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.fr ou par courrier postal : Creative Commons, 171 Second Street, Suite 300, San Francisco, California 94105, USA. Cette licence vous permet de remixer, arranger, et adapter cette uvre des fins non commerciales tant que vous crditez lauteur en citant son nom et que les nouvelles uvres sont diffuses selon les mmes conditions. http://coop-ist.cirad.fr/http://journals.plos.org/plosone/s/submission-guidelines#loc-materials-and-methodshttp://orbi.ulg.ac.be/handle/2268/109540http://www.sfedit.net/newsletters.htmhttp://www.software.ac.uk/resources/guides/which-journals-should-i-publish-my-softwarehttp://journalauthors.tandf.co.uk/preparation/writing.asp#link16http://url.cirad.fr/ist/materiel-methodehttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.fr1. Les matriels et mthodes expliquent comment vous avez men votre exprience2. Dcrivez les mthodes et citez les sources3. Structurez la section Matriels et mthodes4. Soyez attentif aux mthodes statistiques5. Faites attention aux pratiques du journal6. Publier les mthodes : cela se pratique de plus en plusOuvrages et liens utiles

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