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TD3: support du cours/TD

Auteur: PRAG D BRUANT Livres de complément: -Maillet (Biologie cellulaire) Masson -Alberts (la cellule) Médecine-science Flammarion -Koolman (Atlas de poche de biochimie) Médecine-science Flammarion

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Mitochondrie

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st2s-casteilla.net esculape.com

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imagesbiogeolfxm.free.fr uic.edu

Synthétise 300 ATP par seconde

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Polysome

quatuor.org

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Noyau

webiologie.free.fr biochimej.univ-angers.fr

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REG

etab.ac-caen.fr bio.m2osw.com

Canalicules reliés par des ponts

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Appareil de Golgi

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biochimej.univ-angers.fr

0 min

30 min

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stearnslab.stanford.edu et fr.wikipedia.org

Centrosome

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universe-review.ca

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frontiers-in-genetics.org mpronovost.ep.profweb.qc.ca ulysse.u-bordeaux.fr

Cytosquelette

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bioweb.wku.edu

Lysosome

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http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Animal_Cell.svg

Vue globale

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Un codon est une séquence nucléotidique de 3 nucléotides au niveau de l’ARNm qui est spécifique à un acide aminé.

Un anticodon est une séquence nucléotidique de 3 nucléotides au niveau de l’ARNt qui est complémentaire au codon et permet à l’ARNt de fixer l’ARNm.

Les bases azotés: A: adénine U: uracile G: guanine C: cytosine

L’adénine est complémentaire de l’uracile et inversement. La guanine est complémentaire de la cytosine et inversement.

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A = U G C

Liaison hydrogène

sparknotes.com fr.wikipedia.org

ARN

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ed414-openlab.unistra.fr tpe-adn-cdg.e-monsite.com

Dans l’ADN

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Adénine uracile

Différences structurales entre ADN et ARN -Une base modifiée (thymine en uracile)

-Le désoxyribose (sucre) en ribose

ribose

ufrgs.br fr.wikipedia.org tp-svt.pagesperso-orange.fr

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L’ARNm porte l’information génétique de l’ADN et permet la synthèse des protéines grâce à l’ordre précis des codons.

L’ARNt porte l’acide aminé correspondant au codon de l’ARNm.

L’ARNr intervient dans la composition du ribosome et celui-ci permet l’enchainement des acides aminés dans l’ordre correspondant à l’information portés par l’ARNm.

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Dégénéré: un codon peut correspondre à un ou plusieurs acide aminé. (Exemple: le tryptophane est codé seulement par UGG la leucine est codé par 6codons distincts)

Universel: tous les êtres vivants possèdent le même code génétique

Codon initiateur: le même codon est utilisé afin de démarrer la traduction, il s’agit de AUG pour la méthionine

Codons STOP: Il existe 3 codons terminateurs qui obligent le ribosome à arrêter la traduction et à libérer la séquence polypeptidique dans le cytoplasme.

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1: Ribosome

2: REG

3: appareil de Golgi (CGN + dictyosome + TGN)

4: membrane plasmique

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- Dans la membrane plasmique

Devenirs:

- Exocytose (milieu extracellulaire)

- Formation de lysosome

- Retour vers le REG

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Animation traduction

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Les deux sous-unités du ribosome s’assemblent autour du codon initiateur (AUG) de l’ARNm. Le premier ARNt porteur de l’acide aminé (méthionine) se fixe dans le site P (peptidyl) grâce à la complémentarité des bases. De l’énergie est utilisée sous forme de GTP.

Le premier ARNt porteur de l’acide aminé (méthionine) se fixe dans le site P (peptidyl). Un deuxième ARNt dont l’anticodon est complémentaire au codon se fixe dans le site A (aminoacyl). Cet ARNt porte l’acide aminé correspondant au codon. De l’énergie est utilisée sous forme de GTP.

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Le premier acide aminé (méthionine) se fixe au deuxième acide aminé par une enzyme (aminoacylpeptidyltransférase) et de l’énergie sous forme de GTP.

Le ribosome avance d’un triplet (3 bases) et l’ARNt porteur de deux acides aminés se trouve dans le site P. Un autre ARNt se positionne dans le site A grâce à la complémentarité des bases (anticodon complémentaire du codon). Il porte l’acide aminé correspondant au codon. De l’énergie est utilisée sous forme de GTP.

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Le mécanisme se poursuit jusqu’à l’apparition d’un codon STOP dans le site A.

Le codon STOP permet l’arrêt de la chaine polypeptidique. Le ribosome se dissocie de l’ARNm. La chaine polypeptidique est libérée dans le cytoplasme et la méthionine (acide aminé n°1) peut être éliminée. La chaine polypeptidique passe dans les organites (RE et appareil de Golgi) pour y être modifiée puis envoyée vers son lieu d’utilisation.

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La traduction non simplifiée chez les Procaryotes (intervention des facteurs)

nouveautés nouveautés

1

2 3

4

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Transcription: Ensemble d’étapes qui permet la synthèse d’un ARN à partir d’un ADN codant

Traduction: Ensemble d’étapes qui permet la synthèse d’une séquence polypeptidique à partir d’un ARNm

Traduction

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Si anticodon est UAA, l’acide aminé correspondant est:

Trouver le codon?

Trouver la localisation de l’anticodon?

Trouver l’acide aminé?

C’est sur l’ARNt

C’est l’inverse du codon donc AUU

donc Isoleucine

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Exemples de polypeptide:

• Anticorps (glycoprotéine): défense

• Hémoglobine (glycoprotéine): fixation dioxygène

• Insuline (peptide): hormone hypoglycémiante

• GH (protéine): hormone de croissance

• Amylase (protéine): enzyme hydrolytique

• ….