UE Informatique graphique appliquée à la Biochimie – Licence de Biochimie 1 G. Deléage g.deleage@ibcp.fr

UE Informatique Graphique en Biochimie (UE Biochimie optionnelle 3 crédits)

resp: G. Deléage

Ecrire un petit programme informatique PROT_3D en langage Visual Basic qui permet à un utilisateur de manipuler interactivement un objet 3D (une structure 3D de protéine) au moyen de la souris.

Petit : Environ 500 lignes d’instructions au total

Programme : Liste d’instructions à interpréter et exécuter dans l’ordre ou elles apparaissent dans la liste (Une instruction par ligne)

Informatique : C’est l’ordinateur qui va interpréter et exécuter le programme

Langage Visual Basic: Langue conventionnelle utilisant une syntaxe particulière et précise (attention aux fautes…) utilisé dans Word, Excel, Powerpoint

Manipuler interactivement : Le programme et l’utilisateur interagissent au moyen d’une interface (souris, clavier).

Objet 3D: • Rotation (X,Y,Z)• Translation (X,Y,Z)

x

y

z

UE Informatique graphique appliquée à la Biochimie – Licence de Biochimie 2 G. Deléage g.deleage@ibcp.fr

Programme – contenu de l’UE

Réalisation d’un logiciel simple de visualisation et manipulation interactive de structures 3D de protéines.Notions fondamentales de programmation évènementielle (10H CM)Les éléments essentiels du langage. Les types supportés. Principales fonctions. Routines.Notions d’objets, propriétés, méthodes et événements.Graphismes interactifs,…Principe de base (langage indépendant) de visualisition.Déplacements par souris et clavier d’un objet 3D.Applications pour la biochimie à travers l’écriture d’un petit logiciel intégré. (20H TP sur machines disposant de Windows 2000 et de VB6.0 Professional)Ecriture d’un système de lecture de format de fichiers de structures 3D.Les principes de la visualisation 3D de molécules (mode trace alpha)Animation de la molécule au moyen de la souris.Programmation de vue stéréoscopique

Compétences acquisesMéthodologiques :L’objectif est que chaque étudiant soit autonome pour écrire un petit logiciel possédant du graphisme interactif.Techniques :Acquisition des principes de programmation graphique (Mise à l’échelle, repères, axes, tracé de courbe simple, interactivité (redimensionnement, déplacement de curseur, copier/coller,sauvegarde).Secteur d’activité concerné : Informatique/Biochimie/Chimie

UE Informatique graphique appliquée à la Biochimie – Licence de Biochimie 3 G. Deléage g.deleage@ibcp.fr

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